Intérêt de la CGH-array dans les hémopathies malignes

Nouhaud, Malika (2020) Intérêt de la CGH-array dans les hémopathies malignes. Thèse d'exercice en Thèses > Pharmacie, Université Toulouse III - Paul Sabatier.

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Résumé en français

Introduction : la cytogénétique est un maillon indispensable dans la prise en charge des hémopathies malignes. Elle peut avoir un intérêt diagnostique, pronostique ou encore thérapeutique. Le caryotype reste l’examen de choix pour la plupart des pathologies dans la mesure où des métaphases peuvent être obtenues. Par contre, sa résolution n’est pas en mesure de détecter des anomalies de petite taille. La FISH permet de combler en partie ce défaut en détectant des anomalies ciblées avec une résolution de l’ordre de quelques milliers de kb contre 10 millions de kb pour le caryotype. La CGH array a été une avancée majeure en permettant de combiner une haute résolution (de l’ordre du kb) et une vue pangénomique. A l’aire de la biologie moléculaire, cette technique n’est pas recommandée en routine. Matériels et méthodes : afin de montrer l’intérêt de la CGH array dans les hémopathies malignes, nous avons utilisé cette technique sur 4 patients d’intérêt ayant 4 pathologies différentes : une LAL-B double hit à caryotype complexe (patient A), une leucémie myélo-monocytaire chronique (patient B), une leucémie myéloïde chronique (patient C) et une leucémie lymphoïde chronique à caryotype complexe (patient D). Pour cela, des puces humaines SURE Print G3 au format de 1x1M (Agilent) ont été utilisées. Résultats : pour le patient A, le caryotype reste indispensable afin de visualiser les translocations équilibrées. Toutefois, la CGH array a permis de préciser les gains et pertes des anomalies visualisées au caryotype. Chez le patient B, plusieurs isochromosomes 21 ont été retrouvés au caryotype. La CGH array a permis de comprendre la construction des isochromosomes. La CGH array a mis en évidence une délétion du gène TP53 chez le patient C. Cette délétion était invisible au caryotype car de trop petite taille. L’étude en CGH array chez le patient D a montré qu’il existait probablement plus de sous-clones que ceux visibles au caryotype. Elle a permis de mieux comprendre certains remaniements et d’affiner des points de cassure. Conclusion : recourir à la CGH array dans les hémopathies malignes peut donner des informations beaucoup plus détaillées sur le génome que le caryotype et/ou la FISH. Cette technique peut être complémentaire au caryotype et à la FISH pour visualiser de petits remaniements ou comprendre des remaniements complexes. Son utilisation dans de futurs essais cliniques pourrait déterminer leur pertinence clinique et pronostique.

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