Etude des marqueurs virologiques au cours de l'infection à SARS-CoV-2 chez les patients transplantés d'organe au CHU de Toulouse

Parraud, Delphine (2021) Etude des marqueurs virologiques au cours de l'infection à SARS-CoV-2 chez les patients transplantés d'organe au CHU de Toulouse. Thèse d'exercice en Thèses > Pharmacie, Université Toulouse III - Paul Sabatier.

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Résumé en français

La maladie à coronavirus 2019 ou COVID-19 est une infection zoonotique virale aiguë causée par le SARS-CoV-2. Il s'agit d'un virus enveloppé avec un génome à ARN, dont la transmission est respiratoire. Ce virus est responsable d'une infection allant de la forme asymptomatique aux formes graves caractérisées par un syndrome respiratoire aigu sévère pouvant entrainer une défaillance multi-viscérale. Certaines populations sont considérées comme à risque de développer une forme grave de la maladie, dont les patients transplantés d'organe. L'objectif de ce travail était de faire un état des lieux sur l'infection à SARS-CoV-2 chez les patients transplantés d'organe solide hospitalisés au CHU de Toulouse entre mars 2020 et juin 2021, en étudiant les marqueurs virologiques et biologiques au cours de l'infection. Nous avons cherché à mettre en évidence un lien entre ces marqueurs et la sévérité de l'infection, ainsi qu'avec sa létalité. Nous avons recueilli les échantillons de 103 patients transplantés chez lesquels nous avons relevé entre autre la virémie, l'excrétion urinaire et fécale du virus, l'apparition d'anticorps, ainsi qu'un panel de paramètres biologiques étudiant la fonction rénale, hépatique, cardiaque et la réponse immunitaire. Dans ce groupe de patients nous avons relevé 31% de formes sévères (n= 32) et 9% de létalité (n=10). La sévérité de la maladie est liée à une élévation des paramètres inflammatoires (D-dimères et CRP), à une lymphopénie portée notamment sur les lymphocytes TCD3+ et TCD4+, à une excrétion prolongée du virus au niveau nasopharyngé et un traitement par mycophénolate mofétil. La létalité est liée elle à l'âge, la médiane d'âge dans le groupe des patients décédés étant de 70 ans contre 57 ans chez les patients non décédés, ainsi qu'à une élévation des D-dimères, de la troponine et des TGO. La virémie est elle aussi en lien avec la létalité : nous avons retrouvé 44% de virémies positives au sein des patients décédés contre 13% chez les patients non décédés (p=0,032). L'excrétion du virus dans les selles a été retrouvée dans 74% des cas (42/57) et n'est pas liée ni à la sévérité ni à la létalité de la maladie. La détection urinaire du virus s'est avérée être une contamination fécale des urines, en effet les patients ayant des urines positives (8/70) ne présentaient pas d'atteinte rénale plus sévère ni de virémie. En conclusion, parmi les paramètres virologiques étudiés, l'excrétion prolongée du virus est associée aux formes sévères, et la virémie est associée au décès chez les patients transplantés d'organe solide.

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