Mise au point d'une méthode d'analyse pour la recherche de variations candidates en mosaïque, appliquée à une cohorte de 1490 patients atteints de paraplégie spastique héréditaire

Ivashchenko, Véronique (2022) Mise au point d'une méthode d'analyse pour la recherche de variations candidates en mosaïque, appliquée à une cohorte de 1490 patients atteints de paraplégie spastique héréditaire. Thèse d'exercice en Thèses > Médecine spécialisée, Université Toulouse III - Paul Sabatier.

PDF (Accès restreint. S'adresser à l'accueil de la BU Santé de Toulouse) Restricted to Accès intranet Télécharger (3MB)

Résumé en français

Les paraplégies spastiques héréditaires (PSH) sont un groupe hétérogène de pathologies neurologiques d'origine génétique. Plus de 80 loci ont été impliqués à ce jour, avec un âge de début variable et de multiples modes de transmission décrits (autosomique dominant, autosomique récessif, lie à l'X, mitochondrial). Récemment, un petit nombre de variations pathogènes sous forme de mosaïques dans le gène SPAST ont été publiées. Nous avons cherché à mettre à jour de nouvelles variations candidates en mosaïque dans ce groupe de pathologies. Pour cela, nous avons réanalysé les données de séquençage de 1490 patients atteints de PSH par une stratégie combinant une nouvelle détection de variations par le pipeline bio-informatique Oryci, associée à une analyse d'aval destinée à filtrer et prioriser les variations de faible fréquence allélique identifiées. Grâce à ce travail, nous avons pu mettre en avant dix variations en mosaïque d'intérêt dans sept gènes de PSH, dont la vérification est en cours.

Actions (login required)

Voir document