Escherichia coli producteurs de shigatoxines (stec) : état des lieux au CHU de Toulouse

Jacquez, Aude (2020) Escherichia coli producteurs de shigatoxines (stec) : état des lieux au CHU de Toulouse. Thèse d'exercice en Thèses > Pharmacie, Université Toulouse III - Paul Sabatier.

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Résumé en français

Les STEC (E.coli producteurs de shigatoxines) sont responsables de diarrhées de sévérité variable, et peuvent se compliquer de SHU, causant des insuffisances rénales chez l'enfant de moins de 5 ans. Ce travail consiste en un état des lieux des souches de STEC circulant dans les selles de patients au CHU de Toulouse entre juillet 2018 et juillet 2020. Nous avons mis en place une PCR multiplex visant les sérogroupes O157, O26, O80, O145, O45, O121, O111 et O103 sur le LightCycler 480 de Roche. Pour valider la méthode, nous avons procédé à une étape de contamination de selles négatives par des souches sérotypées de référence, afin de déterminer le lien entre la PCR multiplex visant les sérogroupes et la PCR visant les facteurs de virulence stx1, stx2 et eae. Nous avons ensuite passé 190 selles stx+ de patients : 84 sérogroupes ont été détectés, les plus fréquents étant O45, O26 et O80. Chez les patients souffrant de SHU, le sérogroupe O26 était le plus représenté, suivi de O80. La répartition des sérogroupes est cohérente avec celle décrite par le CNR des E.coli (institut Pasteur, Paris).

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