Evaluation des performances de différentes stratégies de diagnostic du paludisme d'importation basées sur des techniques de microscopie, de tests de diagnostic rapide (TDR) et d'amplification isotherme médiée par boucles (LAMP)

Benichou, Etienne (2020) Evaluation des performances de différentes stratégies de diagnostic du paludisme d'importation basées sur des techniques de microscopie, de tests de diagnostic rapide (TDR) et d'amplification isotherme médiée par boucles (LAMP). Thèse d'exercice en Thèses > Pharmacie, Université Toulouse III - Paul Sabatier.

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Résumé en français

Le paludisme est l'une des maladies tropicales les plus couramment rencontrées chez les voyageurs et les migrants. Elle nécessite un diagnostic urgent et fiable compte tenu de sa gravité potentielle. Dans cette étude, les performances de cinq tests de diagnostic ont été évaluées, dans une région non-endémique, et comparées de manière prospective à la PCR quantitative (qPCR). L’étude prospective a été menée à l'hôpital de Toulouse entre août 2017 et janvier 2018 et a inclus tous les patients ayant subi un dépistage initial de paludisme. Un frottis sanguin (FM), une goutte épaisse (GE), un quantitative buffy coat (QBC), un test de diagnostic rapide (TDR) et une amplification isotherme médiée par boucles (LAMP) sous forme de kit commercial ont été réalisés indépendamment sur chaque échantillon sanguin et comparés à notre méthode de référence, la qPCR. Une analyse rétrospective a également été effectuée sur 98 échantillons sanguins congelés, comparant la méthode LAMP et la qPCR. Dans l'étude prospective, 331 patients ont été inclus, principalement de retour d'Afrique. La qPCR a détecté 73 échantillons positifs au genre Plasmodium (dont 58 P. falciparum). La méthode LAMP seule a présenté une sensibilité de 97,3%, confirmée par l’analyse rétrospective (97,3%), loin devant le FM (84,9%), la GE, le QBC et le TDR (86,3%). Le TDR a cependant montré une sensibilité élevée pour P. falciparum (98,3%), mais a raté tous les Plasmodium ovale, malariae et knowlesi. La spécificité a été excellente pour toutes les techniques (99,6%-100%). Les stratégies de diagnostic du paludisme les plus sensibles ont été : FM+TDR (95,9%), FM+LAMP (97,3%) et FM+TDR+LAMP (100%), soit environ 10% de plus que les stratégies utilisant exclusivement la microscopie, FM+GE et FM+QBC (87,7%). Dans les pays non-endémiques, les stratégies uniquement basées sur la microscopie, actuellement recommandées, semblent insatisfaisantes pour le diagnostic du paludisme, compte tenu des performances du TDR et de la méthode LAMP, deux techniques rapides, sensibles et qui nécessitent une formation limitée. Toutefois, le FM reste nécessaire pour les échantillons positifs afin d’identifier et de quantifier les espèces plasmodiales.

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