Analyse d'image automatisée de l'hybridation in situ en fluorescence pour l'évaluation du statut HER2 dans les cancers du sein

Franchet, Camille (2016) Analyse d'image automatisée de l'hybridation in situ en fluorescence pour l'évaluation du statut HER2 dans les cancers du sein. Thèse d'exercice en Thèses > Médecine spécialisée, Université Toulouse lll - Paul Sabatier.

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Résumé en français

Objectifs : L'évaluation du statut HER2 par le pathologiste dans les cancers du sein requiert fréquemment un recours à l'hybridation in situ en fluorescence (FISH). L'avènement des scanners de lames en fluorescence a permis de numériser les lames de FISH et d'envisager le développement d'analyses d'image automatisées. Notre objectif était d'évaluer la concordance de l'évaluation du statut HER2 en FISH entre l'analyse automatisée et l'analyse manuelle de lames numérisées. Matériels et méthodes : Trois algorithmes de classification des noyaux ont été comparés sur une cohorte technique avec différents paramètres de segmentation nucléaire. Les ajustements post-analyse les plus pertinents ont été évalués. Le meilleur algorithme et les paramètres optimaux ont été utilisés pour analyser une cohorte de validation de 30 cancers du sein. Les résultats obtenus en analyse d'image ont été comparés avec les diagnostics initiaux et les résultats de la lecture manuelle des lames numérisées. Résultats : Une concordance globale forte a été retrouvée entre les résultats d'analyse d'image automatisée, la lecture manuelle des lames numérisées et les diagnostics initiaux (90 et 79% respectivement) en utilisant l'algorithme, les paramètres et les ajustements post-analyse optimaux définis dans l'étape technique. Conclusion : L'analyse d'image automatisée constitue une aide fiable et reproductible pour l'évaluation du statut HER2 en FISH.

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