Quel est l'apport du flacon d'hémoculture en milieu anaérobie dans le diagnostic et la prise en charge clinique des patients bactériémiques ?

Anglejan Chatillon, Emma d' (2016) Quel est l'apport du flacon d'hémoculture en milieu anaérobie dans le diagnostic et la prise en charge clinique des patients bactériémiques ? Thèse d'exercice en Thèses > Médecine générale, Université Toulouse lll - Paul Sabatier.

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Résumé en français

Les hémocultures sont habituellement constituées d'un flacon aérobie et d'un flacon anaérobie. D'après les données de la littérature, le flacon anaérobie se positive de façon isolée dans 20% des cas, et seulement 5% des épisodes de bactériémie sont associés à la présence de germe anaérobie. L'intérêt du flacon d'hémocultures en milieu anaérobie reste donc débattu. Nous avons réalisé une étude rétrospective sur 6 mois afin d'évaluer l'intérêt du flacon anaérobie pour le diagnostic et la prise en charge des patients bactériémiques. Chaque hémoculture positive a été associée à un épisode défini comme au moins une hémoculture positive au même pathogène dans une période de 7 jours. Après exclusion des épisodes liés à des germes définis comme des contaminants, les épisodes pour lesquels seul le flacon anaérobie permettait de retrouver le pathogène ont été analysés. Les données cliniques et biologiques des patients ayant présenté ces épisodes ont été analysés. Au total 19739 paires d'hémocultures (constituées d'un flacon aérobie et un flacon anaérobie) ont été prélevées sur cette période. Quatre mille cinq cent quarante-cinq paires (24%) d'hémocultures sont revenues positives (au moins un flacon positif voire les deux) et représentaient 1081 épisodes de bactériémie. Les flacons aérobies et anaérobies étaient positifs seuls respectivement dans 309 épisodes (29%) et dans 209 épisodes (19%). Parmi ces 209 épisodes où seul le flacon anaérobie était positif, on notait 124 contaminations et 84 épisodes de bactériémies vraies. Les bactéries isolées étaient principalement des entérobactéries dans 31/84 épisodes (37%), des entérocoques dans 17/84 épisodes (20%), des germes anaérobies stricts dans 16/84 épisodes (19%), des Staphylocoques dans 9/84 épisodes (10%), des Pseudomonas dans 3/84 épisodes (3,5%). Les seize épisodes de bactériémies à germe anaérobie strict ont été étudiés. La porte d'entrée des infections à germes anaérobies stricts était majoritairement abdominale dans 8/16 épisodes (50%) et pulmonaire pour 2/16 épisodes (13%). D'un point de vue clinique, 7/16 épisodes (44%) sont survenus dans un contexte de pathologie hématologique et 8/16 (50%) dans le cadre d'un traitement immunosuppresseur. Dans 9 épisodes (56%) le germe retrouvé était sensible au traitement probabiliste débuté avant l'obtention des résultats des hémocultures. Le traitement a été adapté secondairement aux résultats dans 8 épisodes (50%). La mortalité était élevée, 5 patients (25%) étant morts dans les 30 jours suivants la première hémoculture positive. Le flacon anaérobie a donc permis de documenter une bactériémie vraie dans 84 épisodes (soit 8%). Cependant, seuls 16 des 1081 épisodes analysés (1%) étaient dus un germe anaérobie strict. La contribution en terme de diagnostic des flacons anaérobies pourrait alors être liée plus au volume de sang supplémentaire prélevé avec le flacon anaérobie qu'à sa spécificité de milieu de culture anaérobie. Le pronostic des patients ayant une hémoculture à un germe anaérobie strict était sévère (mortalité à 30 jours de 25%), la bactériémie survenant souvent dans un contexte de réanimation, de neutropénie fébrile et/ou de bactériémies poly-microbiennes. Dans 50% des cas le résultat des hémocultures a conduit à une modification thérapeutique, ce qui est particulièrement important pour des patients vulnérables.

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